Hogyan lehet kiszámítani a peptidek izoelektromos pontját

Szerző: Gregory Harris
A Teremtés Dátuma: 7 Április 2021
Frissítés Dátuma: 20 November 2024
Anonim
Hogyan lehet kiszámítani a peptidek izoelektromos pontját - Élet
Hogyan lehet kiszámítani a peptidek izoelektromos pontját - Élet

Tartalom

A peptidek rövid polimerek töredékei, amelyek aminosavakból állnak. Minden peptidnek van egy bizonyos aminosav-szekvenciája, amelyet hárombetűs vagy csak egy betűs kód jelöl; például az alanin aminosav rövidítése "Ala" vagy "A". Az oldat peptidterhelése savasságától függ. Az izoelektromos pont (pl) az oldat savasságának értékére utal, amelyben a peptidmolekula nettó töltése nulla. A peptid oldhatósága az izoelektromos ponton minimális. Használja a rendelkezésre álló webszervereket a peptid aminosav-szekvenciájának pI-értékének kiszámításához.

1. lépés

Szekvenciázza a peptidet egybetűs kód segítségével. Például, ha egy peptid aminosavszekvenciája Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alanin - szerin - glutaminsav - leucin - prolin), akkor az egybetűs szekvencia "ASELP" lenne. Ha szükséges, olvassa el az erőforrások szakaszban található egybetűs-hárombetűs konverziós táblázatot.


2. lépés

Bármilyen böngészővel, például Internet Explorer vagy Firefox segítségével írja be a kiszolgálót, amely kiszámítja a peptid izoelektromos pontját (pI); lásd: Források.

3. lépés

Írja be a peptid egybetűs szekvenciáját - példánkban "ASELP" - a mezőbe, majd kattintson a "Számítás" gombra.

4. lépés

Olvassa el az "Elméleti pI / Mw" (elméleti pl) sorban megadott izoelektromos pont (pI) értékét. Példánkban a pI 4,00. Vegye figyelembe, hogy a szerver kiszámítja a peptid molekulatömegét (Mw) is.